Ponieważ deszcz może być narażony na zanieczyszczenia w powietrzu lub w metodzie zbierania, może być zbyt "brudny" do picia. Woda deszczowa ogólnie nie nadaje się do użycia jako woda pitna bez testowania i ewentualnego leczenia.
Zanieczyszczenie, takie jak sadza, dym i pył, może zostać włączone do wody deszczowej, gdy spada ona przez atmosferę. Na obszarach rolniczych pozostałości nawozów w powietrzu mogą przyczyniać się do większego stężenia azotanów w wodzie deszczowej. Metoda zbierania wody deszczowej może zmywać pleśnie, algi, bakterie i inne substancje organiczne w pojemnikach do przechowywania. Trudno jest bezpiecznie zebrać znaczną ilość wody deszczowej bez ryzyka, że przynajmniej niektóre ptasie odchody zlikwidują w beczce z deszczem.
Zbieranie wody deszczowej do użytku do picia jest jednak możliwe, a pierwszym krokiem jest przetestowanie wody w celu upewnienia się, że można ją łatwo oczyścić. Dostępne są systemy zbierania wody deszczowej, które zapewniają wytyczne i urządzenia do bezpiecznego zbierania, filtrowania i uzdatniania wody deszczowej do picia.
