Krokodyle to nie dinozaury, ale obie grupy są blisko spokrewnione. Zarówno dinozaury, jak i krokodyle są uważane za archozaury, specjalną grupę gadów, które odróżniają się od podobnych zwierząt dzięki pojedynczemu otwarciu czaszki w przód każdego oka.
Krokodyle dzielą się z innymi bliskimi krewnymi. Zarówno krokodyle, jak i dinozaury mają zęby ustawione w szczękach. Chroni to zęby przed wyrwaniem podczas gryzienia. Krokodyle i dinozaury mają również specjalnie ukształtowane stawy skokowe i dodatkowy grzbiet na kości udowej, który pozwala na silniejszą muskulaturę nóg.
Bardzo stare linie krokodyli przypominały dinozaury bardziej niż zwierzęta, które widzimy dzisiaj. Szli na dwóch nogach i mieszkali na lądzie. Krokodyle nie stały się wyspecjalizowane do życia w wodzie do około 200 milionów lat temu. To wtedy przyjęli swoją nowoczesną formę długich, eleganckich czworonożnych zwierząt z rozległym, jaszczurczym chodem.