Komórki prokariotyczne nie mają prawdziwego jądra. Słowo "prokariotyczny" oznacza "przed jądrem". Natomiast komórki eukariotyczne pojawiły się po prokariotach i zawierają struktury nieobecne w komórkach prokariotycznych.
Jedynymi organizmami prokariotycznymi są gatunki bakterii. Zamiast jądra prokarioty mają region zwany nukleoidem. Obszar ten zawiera materiał genetyczny bakterii w formie kolistej. Prokariota może również zawierać jeden lub więcej plazmidów, które są strukturami kołowymi, które również zawierają pewien materiał genetyczny. Plazmidy te mogą przenosić się z jednej komórki prokariotycznej do innej.
Oprócz braku jądra komórki prokariotyczne również nie posiadają innych organelli, struktur związanych z błoną, które znajdują się w eukariotach. Organelle obejmują składniki komórkowe, takie jak mitochondria, chloroplasty, rybosomy, ciała Golgiego i retikulię endoplazmatyczną.