Jedną z głównych cech fosfolipidów jest organizacja dwuwarstwowa, na której zbudowana jest reszta membrany. Struktury w fosfolipidach są cegiełkami dla części błony, która ten rodzaj lipidów pomaga tworzyć. Mają bardzo wyraźny wzór, ponieważ łańcuchy kwasów tłuszczowych w podwójnych warstwach wskazują na membranę, co czyni ją kluczowym wskaźnikiem tego typu lipidu.
Inną cechą tego typu lipidów jest to, że obszar określany jako głowa lipidu jest przyciągany do wody, podczas gdy druga strona jest odpychana przez wodę. Podstawową strukturą fosfolipidów, która jest wbudowana do tworzenia różnych typów lipidów, jest głowa glicerolu i ogon składający się z kwasów tłuszczowych.