Kolonie drożdżowe są większe niż kolonie bakterii, ponieważ poszczególne komórki drożdży są znacznie większe niż komórki bakterii. Zarówno drożdże, jak i bakterie są jednokomórkowymi mikroorganizmami, ale drożdże są eukariotami, a bakterie są prokariotami. Komórka eukariotyczna zawiera jądro i organelle strukturalne zamknięte w podwójnej membranie. Drożdże mają również grube ściany komórkowe, które otaczają organizm. Prokarionty, takie jak bakterie, są mniejsze, ponieważ brak im jądra i organelli związanych z błoną.
Komórki drożdży zwiększają liczbę bezpłciowo poprzez pączkowanie. Jak wyjaśnił Gary Kaiser w Community College of Baltimore County, bud tworzy się na zewnętrznej powierzchni komórki macierzystej, a jądro komórki dzieli się. Jedno z podzielonych jąder wchodzi do pąka tworzącego, a materiał ściany komórkowej jest wytwarzany pomiędzy komórką macierzystą a pączkiem. Pączek zrywa się, by stać się nową córką. To rozmnożenie genetycznie identycznych komórek drożdży wprowadza się do kolonii. Bakterie dzielą i zasiedlają kolonie poprzez rozszczepienie binarne, inną formę rozmnażania bezpłciowego. Okrągłe DNA bakterii ulega replikacji, a kopie są rozdzielane na przeciwległe końce komórki. Ściana komórkowa bakterii rośnie, tworząc szczelinę w środku komórki. Szczelina ostatecznie zaciska rozszczepialną komórkę na dwie oddzielne, ale identyczne komórki potomne. Rozszczepienie binarne trwa w każdej komórce potomnej, zapełniając kolonię bakteryjną.
