W marcu 1991 r. i kwietniu 1991 r. magma wznosząca się 20 mil pod powierzchnią wulkanu Pinatubo spowodowała wiele trzęsień ziemi i małych eksplozji, które zniszczyły części wulkanu. W dniu 12 czerwca 1991 r. magma wypełniony gazem dotarł na powierzchnię i wulkan wybuchł.
Przed erupcją w 1991 r. wulkan był w dużej mierze nieaktywny przez 500 lat. 16 lipca 1990 roku nastąpiło trzęsienie ziemi o sile 7,8, które miało miejsce 60 mil od wulkanu, który zakłócił skorupę ziemską pod Pinatubo. Chociaż to trzęsienie ziemi spowodowało mniejsze trzęsienia ziemi i osunięcia ziemi w pobliżu wulkanu, nie wydawało się, aby te wydarzenia znacznie podburzyły wulkan.
Pierwsza magma, która zaczęła wynurzać się na powierzchnię w marcu 1991 r., straciła większość swojej zawartości gazu w drodze do góry. Kiedy dotarł na powierzchnię, powoli wypłynął i spadł ze zbocza wulkanu. Po początkowej eksplozji, 15 czerwca 1991 r. Było więcej magmy, która spowodowała gwałtowniejsze wybuchy, ponieważ ma znacznie wyższą zawartość gazu.
Gazy w magmie normalnie rozpuszczają się, gdy znajdują się głęboko pod powierzchnią. Jednak te gazy, które były odpowiedzialne za erupcję, rozszerzyły się wraz ze wzrostem magmy z powodu niskiego ciśnienia.