Chociaż różne teorie dotyczące sprawy 9/11 różnią się znacznie i obejmują teorię spiskowców, że jest to wewnętrzna praca rządu Stanów Zjednoczonych, większość ludzi uważa, że miała ona zaprotestować przeciwko amerykańskiemu wsparciu Izrael oraz jego obecność na Bliskim Wschodzie w ogóle. Wśród atakujących byli rzekomo muzułmańscy terroryści z kilku krajów Bliskiego Wschodu finansowani przez Osamę bin Ladena. Każdy z 19 porywaczy, którzy wspólnie przejęli kontrolę nad czterema handlowymi samolocikami zamierzającymi popełnić samobójcze ataki, był powiązany bezpośrednio z grupą terroryzmu al-Kaidy bin Ladena.
Bin Laden ogłosił świętą wojnę przeciwko Stanom Zjednoczonym w 1998 roku. W tym czasie wezwał do morderstwa amerykańskich cywilów w fatwę, którą podpisał. Kilku naukowców z Bliskiego Wschodu sądzi, że 911 to sposób, w jaki bin Laden prowokował USA do wojny, która podburza muzułmanów na całym świecie do zjednoczenia się w opozycji do Zachodu.
Krytycy rządu federalnego twierdzą, że niepowodzenie w pokrzyżowaniu 9/11 było wynikiem tego, że rząd USA nie dzielił się informacjami z różnymi agencjami wywiadowczymi, z których kilka wcześniej ostrzegało o częściach działki z 11 września.
Inni obwiniają brak bezpieczeństwa na lotniskach, wskazując na fakt, że terroryści z powodzeniem przeszmuglowali noże i maszyny do cięcia boków na samoloty w trzech portach lotniczych na wschodnim wybrzeżu.
