Dowody teorii ograniczają się do zamkniętych systemów logiki analitycznej i matematyki, podczas gdy nauka wyjaśnia naturę jako dynamiczną całość. Dowody są ostateczne i binarne - dwie cechy, które nie mogą istnieć w czymś tak żywym i zmieniającym się jak nauka. Również teorie mogą zostać sfalsyfikowane po odkryciu nowych dowodów.
Teoria jest akceptowana przez naukowców, gdy istnieje jako najlepsze wytłumaczenie spośród innych alternatyw, jeśli w ogóle istnieje. Akceptacja teorii zależy od pojawienia się czegoś lepszego lub od jego sfałszowania przez nowe dowody. Nawet fakt naukowy, który określa Wolny Słownik jako potwierdzona obserwacja przyjęta jako prawda, nie jest ostateczny.
Celem nauki jest wyjaśnienie natury i wyeliminowanie teorii rywali. Niektóre teorie naukowe są szerzej akceptowane, ponieważ są albo najlepszym wyjaśnieniem danego zjawiska, albo po prostu bardziej wiarygodne. Jednak wiarygodność nie jest prawdziwym kryterium naukowym.
Nawet jeśli teoria jest sfałszowana, nie musi to oznaczać, że zjawisko to jest kwestionowane. Na przykład teoria grawitacji jest wytłumaczeniem działania grawitacji, ale jeśli okaże się, że jest ona wadliwa, nie oznacza to, że grawitacja w ogóle nie istnieje.