Chlorowodorki są przede wszystkim stosowane do przekształcania nierozpuszczalnych amin, aby były rozpuszczalne w wodzie. Najczęstsze stosowanie chlorowodorków występuje w wielu różnych lekach.
Chlorowodorek tramadolu jest przepisanym lekiem przeciwbólowym. Jest stosowany w celu łagodzenia bólu od umiarkowanego do silnego i jest częścią grupy medycznej o nazwie działające środki przeciwbólowe. Potencjalne skutki uboczne to reakcja alergiczna, spowolnione oddychanie, zawroty głowy i zwiększona potliwość.
Chlorowodorek glukozaminy wytwarza się z muszli lub tworzy w laboratorium. Jest stosowany w leczeniu osób z chorobą zwyrodnieniową stawów, bólem kolana, bólem pleców lub jaskrą. Ten konkretny chlorowodorek jest uważany za suplement i może nasilać ataki astmy, zwiększać poziom cukru we krwi u diabetyków i powodować wysoki poziom cholesterolu lub wysokie ciśnienie krwi.
Innym rodzajem chlorowodorku jest chlorowodorek betainy. Jest wytwarzany w laboratorium i jest substancją chemiczną. Chlorowodorek betainy jest suplementem diety i może mieć różną siłę i poziom czystości. Jest stosowany w leczeniu niskiego poziomu potasu, niedokrwistości, zakażeń drożdżowych, chorób tarczycy i infekcji ucha wewnętrznego. Ten dodatek może powodować zgagę lub podrażnienie owrzodzenia żołądka u niektórych użytkowników. Przed przyjęciem jakichkolwiek nowych leków zaleca się rozmowę z lekarzem. Żadnego z tych chlorowodorów nie powinny zażywać kobiety w ciąży lub karmiące piersią.