Ponieważ jajko to cała struktura biologiczna, zbudowana z mieszaniny chemikaliów, a nie pojedynczego czystego związku chemicznego, nie ma jednej chemicznej formuły, która by ją opisała. Jednak podstawowa struktura i chemia jajka jest wysoce konserwatywna i różni się nieznacznie w zależności od gatunku.
Jajo ma trzy główne części: skorupę, białko jaja i żółtko jaja. Powłoka składa się głównie z soli fosforanu wapnia, która jest podobna w składzie do kości ludzkiej. Białko jaja składa się z wody, osmotycznych soli regulacyjnych i białka surowicy zwanego albuminą. Żółtko, które służy jako źródło pożywienia dla rosnącego zarodka ptaka, składa się z wielu rodzajów wysokoenergetycznych lipidów.
