Cykl Krebsa ma miejsce w macierzy mitochondrialnej. Mitochondrialna matryca jest częścią komórki, która zawiera DNA, rybosomy i enzymy katalizujące cykl Krebsa.
Cykl Krebsa, znany również jako cykl kwasu cytrynowego, to seria reakcji chemicznych, które wytwarzają energię dla wszystkich organizmów, które potrzebują tlenu, aby przeżyć. Podczas cyklu pirogronian jest wprowadzany do macierzy mitochondrialnej, a poprzez utlenianie metabolizowany jest do trifosforanu adenozyny, chemicznej formy energii. Dwutlenek węgla powstaje jako produkt uboczny reakcji, a także inne chemikalia niezbędne do tworzenia aminokwasów.