Komórki kubkowe można znaleźć w nabłonku jelita cienkiego i grubego. Te komórki wydzielają śluz, aby pokarm łatwiej przechodzi przez przewód pokarmowy.
Komórki kubkowe wyglądają jak małe puchary i leżą rozproszone pomiędzy chłonnymi komórkami w jelitach. Są one klasyfikowane jako komórki nabłonka gruczołowego. Komórki kubkowe są przykładami jednokomórkowych gruczołów w ludzkim ciele. Liczba komórek kubkowych powiększa się dalej w przewodzie pokarmowym. Na górnym końcu przewodu pokarmowego, w pierwszej części jelita cienkiego zwanego dwunastnicą, liczba komórek wchłaniających znacznie przewyższa liczbę komórek kubkowych. Okrężnica zawiera większy odsetek komórek kubkowych niż jelito cienkie.