Ziemniaki mają 48 chromosomów ułożonych w 24 pary. Liczba chromosomów w żywych organizmach, w tym roślinach, kwiatach i warzywach, jest bardzo różna. Niektóre, takie jak cebula ogrodowa, mają tylko 16 chromosomów, podczas gdy inne gatunki, takie jak paprocie, mają ponad 100 par chromosomów.
Chromosomy ziemniaków, podobnie jak w przypadku innych gatunków roślin i zwierząt, odpowiadają za ich wyjątkowe indywidualne cechy i cechy. Występuje znaczna różnorodność wyglądu i składu biologicznego między roślinami i zwierzętami oraz w królestwie roślin i zwierząt. We wszystkich żywych organizmach chromosomy służą jako ważne obszary do rozmnażania poprzez przechowywanie pasm DNA, które zawierają informacje genetyczne. Większość roślin i zwierząt tego samego gatunku ma tę samą liczbę chromosomów, chociaż liczba chromosomów między gatunkami jest różna. Chociaż ziemniaki mają mniej chromosomów niż wiele typów zwierząt i niektóre rośliny o wyższym poziomie, mają one fizyczne różnice, które wywodzą się z ich konkretnych chromosomów. Chromosomy pomagają odróżnić ponad 5000 różnych gatunków ziemniaków z całego świata. Chromosomy nadają również ziemniakom ich barwę, która waha się od białej skóry do jasnożółtej, różowej lub czerwonej. Geny niektórych ziemniaków są manipulowane syntetycznie, aby wytworzyć hybrydy, rozszerzając ich różnorodność genetyczną.