Liczba protonów, które ma atom, zależy od tego, jakim elementem jest. Na przykład atom wodoru ma tylko jeden proton. Atom azotu ma 7 protonów, atom antymonu ma 51 protonów, a atom radu ma 88 protonów.
Protony określają także liczbę atomową. Dlatego wodór ma liczbę atomową 1, a azot ma liczbę atomową 7.
Protony znajdują się w jądrze atomu. Mają ładunek dodatni. Normalnie w atomie występuje ta sama liczba elektronów co protony. Ponieważ elektrony mają ładunek ujemny, normalny atom nie ma ładunku.
