Koty Maine Coon żyją zwykle od 12 do 15 lat. Są na ogół silne i zdrowe, ale podlegają wielu zaburzeniom genetycznym, w tym dysplazji stawów biodrowych i kardiomiopatii przerostowej kotów.
Dysplazja stawu biodrowego to nieprawidłowość stawu biodrowego, która może powodować kulawizny i artretyzm. Kocia HCM jest najczęstszą przyczyną chorób serca u kotów i jest postępującą chorobą, która może prowadzić do niewydolności serca i nagłej śmierci. Innym zaburzeniem genetycznym występującym czasami u Maine Coonów jest rdzeniowy zanik mięśni, który powoduje osłabienie mięśni i skraca czas życia. Odpowiedzialni hodowcy badają swoje zapasy i kocięta na te schorzenia.
