Schroniska dla zwierząt są finansowane z darowizn, opłat adopcyjnych, zapisów i sprzedaży towarów. Schroniska dla zwierząt organizują również specjalne wydarzenia, takie jak coroczne spacery i kolacje, w celu zebrania funduszy.
Schroniska dla zwierząt kontrolowane przez gminy są finansowane przez rząd. Fundusze często nie wystarczają na pokrycie kosztów operacyjnych. Te schroniska zazwyczaj mają oddziały non-profit, które pomagają pokryć dodatkowe wydatki.
Działania i wydarzenia związane z pozyskiwaniem funduszy, a także darowizny, są głównym źródłem dochodów prywatnych schronisk dla zwierząt. Schroniska dla zwierząt, takie jak Animal Humane Society, zyskują fundusze poprzez zawieranie umów z miastami, aby zapewnić zakwaterowanie dla skonfiskowanych zwierząt. Fundusze te stanowią zaledwie około 1% całkowitego budżetu operacyjnego. Prywatne schroniska nie otrzymują pieniędzy z dotacji rządowej.
Organizacje takie jak Amerykańskie Towarzystwo Zapobiegania Okrucieństwu wobec Zwierząt regularnie zapewniają schronienie dla schronisk dla zwierząt w formie dotacji. Dotacje te wahają się od 500 do 10 000 USD. W przypadku tych grantów brane są pod uwagę tylko zamówione propozycje. American Humane Association oferuje granty w otwartym procesie aplikacyjnym.
Niektóre schroniska dla zwierząt współpracują z dużymi sieciami supermarketów, w których znajdują się pojemniki na darowizny. O różnych porach roku dyski spożywcze są przechowywane w sklepach, aby pomóc w utrzymaniu niedofinansowanych schronień.