Kwaśny deszcz wpływa na zwierzęta poprzez zmianę pH ich środowiska. Zwiększona kwasowość powoduje zmiany anatomiczne, zmniejsza populację niektórych organizmów i może wpływać na rozmnażanie u niektórych gatunków.
National Geographic definiuje kwaśne deszcze jako każdy rodzaj opadów zawierających duże ilości kwasów siarkowego i azotowego. Kiedy kwaśne deszcze docierają do Ziemi, kwasy wchodzą do gleby i wchodzą do systemów wodnych, takich jak rzeki, jeziora i strumienie. W ekosystemach wodnych kwaśne deszcze niszczą zwierzęta, zwiększając kwasowość wody. Zwiększa to ilość aluminium absorbowanego z otaczającej gleby, dzięki czemu woda jest toksyczna dla zwierząt wodnych. W obszarach, w których pH wody spada poniżej pięciu, jest mniej raków i owadów. Zwiększona kwasowość wpływa również na tempo wzrostu i zdolności reprodukcyjne ryb.
Kwaśne deszcze mają również wpływ na zwierzęta żyjące w lesie. Deszcz sprzyja zmianom pH gleby, utrudniając drzewom wchłanianie wody. Skutki kwaśnych deszczy utrudniają drzewom i innym roślinom odporność na choroby, uszkodzenia owadów i zmiany temperatury. Kiedy giną uszkodzone drzewa i rośliny, zwierzęta żyjące w ekosystemie leśnym nie mają za dużo jedzenia.
