Samice nietoperzy dbają o swoje młode od urodzenia, trzymając je w torebce z membraną i pielęgnując je. Przez jakiś czas po urodzeniu mogą przynosić ze sobą swoje maleńkie niemowlęta, gdy karmią, ale matki później zostawiają je w gnieździe, często wracając, aby je nakarmić.
Samice nietoperzy zwykle mają tylko jedno dziecko na raz, prawdopodobnie z powodu potrzeby latania i karmienia nawet w czasie ciąży. Gdy nadejdzie czas porodu, samice niektórych gatunków zwieszają głowę kciukami i łapią dzieci w błonie ogonowej, podczas gdy inne gatunki zwisają głową w dół i łapią dziecko skrzydłami. Szczenięta nietoperza są urodzone, zamknięte, bezwłose i przywierają do swoich matek natychmiast ostrymi szponami, a czasem zębami.
W zależności od wielkości gatunku nietoperza młode nietoperzy mogą przylgnąć do swoich matek podczas lotu i karmienia przez kilka dni do kilku tygodni. Kiedy są zbyt ciężkie, aby je nieść, matki zostawiają je trzymając się ściany, gałęzi, dachu jaskini lub innego schronienia, gdy szukają pożywienia. Wskaźnik śmiertelności młodych nietoperzy jest wysoki, ponieważ niektóre nietoperze spadają z grzęd i nie są w stanie wspiąć się z powrotem.
W zależności od gatunku nietoperza, młode nietoperze w pełni rozwiną skrzydła i uzyskają zdolność latania w ciągu trzech tygodni do czterech miesięcy. Kiedy to robią, są odpowiedzialni za polowanie na własne pożywienie.
