Zebry rozmnażają się seksualnie: zebra męska, zwana ogierem, montuje żeńską zebrę, która nazywa się klaczą, i umieszcza plemniki w pochwie klaczy za pośrednictwem penisa ogiera. Jeśli krycie się powiedzie, klacz urodziła jedno źrebię 12 do 13 miesięcy później.
Stada zebry składają się zazwyczaj z ogiera i kilku klaczy, które stanowią grupę znaną jako harem. Ogiery współzawodniczą ze sobą o prawo do haremu. Gdy ogier wyłoni się zwycięsko, jego roszczenie jest kwestionowane tylko wtedy, gdy inne ogiery odczuwają słabość z powodu choroby lub urazu.
Ogiery osiągają dojrzałość płciową w wieku 4 lat, natomiast klacze osiągają dojrzałość płciową w wieku od 2 do 4 lat. Podobnie jak inne gatunki koni, zebra w rui - czyli w ogniu - często sygnalizuje jej chęć rozmnażania się z ogierem przez "mruganie" warg sromowych lub odwracanie ich na zewnątrz.
Długi okres ciąży obserwowany w zebrach pozwala źrebięciu rozwinąć się na tyle, że w ciągu kilku minut od narodzin może stać. Pomimo tej przewagi rozwojowej śmiertelność noworodków wśród źrebiąt zebranych wynosi około 50 procent. Jeśli źrebię osiąga dojrzałość, średnia oczekiwana długość życia w środowisku naturalnym wynosi od 20 do 25 lat.
