Protiści to jednokomórkowe organizmy, które rozprzestrzeniają choroby, poprzez bezpośrednią infekcję lub poprzez toksyny wydalane do żywności i wody. Infekcje wywołane przez protisty powodują choroby przewodu pokarmowego i układu nerwowego, a także choroby skóry i płuc .
Ameby są protistami, które powodują szereg ludzkich chorób. Są odpowiedzialni za amebową czerwonkę, która powoduje ciężką biegunkę i śmiertelną postać zapalenia mózgu. Ameby mogą również tworzyć zmiany na skórze i oczach, prowadząc do dalszej infekcji lub ślepoty.
Dinoflagellates są protistami, które powodują Red Tide, formę zanieczyszczenia wody. Uwalniają wodę oceaniczną z tlenu, tworząc martwe strefy, które nie mogą utrzymać życia zwierząt. Dinoflagellates również uwalniają toksyny, które zabijają ryby. Ryby, które przeżywają, gromadzą toksyny w ich ciele, powodując nudności, wymioty i objawy neurologiczne u ludzi, którzy je konsumują. Toksyczność dinoflagellatu u ludzi określa się mianem ciguatera lub zatrucia skorupiakami.
Protiści również powodują afrykański śpiączkę i chorobę Chagasa, dwie powiązane choroby, które występują na różnych kontynentach. Ci protistycy pochodzą z rodzaju Trypanosoma i rozprzestrzenili się na ludzi poprzez ukąszenia owadów. Afrykańska choroba nocna jest endemiczna dla zachodniej i centralnej części Afryki, podczas gdy choroba Chagasa występuje w Ameryce Środkowej i Południowej.
