Południowe kolonie miały wiele różnych religii, ale były głównie anglikanami lub baptystami. Środkowe kolonie miały także wiele różnych religii, w tym katolików, Żydów i kwakrów.
Pierwotne prawa kolonii zmuszały ludzi do uczęszczania do pewnego rodzaju kościoła i płacenia podatków, które pomagały płacić za kościoły. Później koloniści postanowili stać się bardziej religijnie tolerancyjni i oddzielić kościół od państwa. Co ciekawe, niezależnie od znaczenia, rozdział kościoła od państwa nie jest wyraźnie zapisany w żadnych przepisach ustanawiających, w tym w Konstytucji Stanów Zjednoczonych. Idea "rozdziału kościoła od państwa" pojawiła się po raz pierwszy, gdy baptyści w Wirginii chcieli tolerancji religijnej od anglikanów zamieszkujących ten obszar.
