Anomalia magnetyczna to odchylenie w polu magnetycznym Ziemi od ogólnej średniej oczekiwanej dla danego obszaru. Anomalie magnetyczne są najczęściej przypisywane różnicom w składzie litosfery, otaczającej bryle skalnej ziemski rdzeń.
Ogólne pole magnetyczne Ziemi jest spowodowane obrotem zewnętrznego rdzenia cieczy, wykonanego z roztopionego metalu i skały. Zasadniczo główne pole magnetyczne jest nadrzędne względem pola magnetycznego wytwarzanego przez skorupę, ale krótsze długości fal magnetycznych są w stanie uciec przed tym maskowaniem. Anomalie magnetyczne są w dużej mierze powodowane przez minerały złożone z magnetytu i tytanu w skorupie. Powyżej pewnego ciśnienia i temperatury te minerały nie są już magnetyczne, więc źródło tych anomalii jest ogólnie ograniczone do powierzchni i od 10 do 30 mil poniżej.