Woda jest najobficiej występującą cząsteczką w komórce. Około 70 procent masy komórki składa się z cząsteczek wody. Skład reszty komórki to cząsteczki organiczne i jony nieorganiczne.
Chociaż są one ważne dla komórki, jony nieorganiczne stanowią zaledwie około 1 procenta masy komórki. Pozostała część masy komórki składa się z cząsteczek organicznych. Są to zazwyczaj węglowodany, kwasy nukleinowe, lipidy lub białka. Ponieważ tlen w wodzie ma nieco ujemny ładunek, a wodór ma nieco dodatni ładunek, woda jest polarna i może reagować z jonami, jak również tworzyć wiązania wodorowe.