Jednym z celów, jakie służą organellom związanym z błoną, jest umożliwienie izolacji i stężenia enzymów i reagentów w niewielkiej przestrzeni. Umożliwia to szybsze i bardziej wydajne reakcje chemiczne w komórce. Związane z błoną organelle mogą również ograniczać szkodliwe białka i cząsteczki z reszty komórki.
Lizosom jest przykładem organelli związanej z błoną, która pomaga chronić komórkę przed szkodliwymi białkami i cząsteczkami poprzez zamknięcie. Organelle jest domem dla wielu enzymów uczestniczących w trawieniu lipidów, białek i kwasów nukleinowych. Chociaż te enzymy pełnią ważną funkcję w obrębie lizosomu, mogą zniszczyć lipidy, białka i kwasy nukleinowe, jeśli zostaną uwolnione do płynu wewnątrzkomórkowego, zwanego cytozolem, co powoduje śmierć komórki. Obecność błony otaczającej lizosom zapobiega temu zjawisku, utrzymując enzymy wewnątrz organelli.
Niektóre inne przykłady organelli związanych z błoną obejmują mitochondria, aparat Golgiego i retikulum endoplazmatyczne. Mitochondria mają po dwie membrany, a wewnętrzna membrana składa się w kryształy. Te cristae służą jako miejsca wytwarzania trójfosforanu adenozyny lub ATP. Aparat Golgiego jest odpowiedzialny za przetwarzanie białek wytwarzanych w retikulum endoplazmatycznym. Retikulum endoplazmatyczne jest obszarem komórki, w którym wytwarzane są lipidy, większość błon komórkowych, wydzielane białka i białka transmembranowe.
