Uniwersytet Mansoura wyjaśnia, że końcowymi produktami trawienia białka w jelicie cienkim są aminokwasy. Aminokwasy są następnie wchłaniane do krwioobiegu przez ściany jelita za pomocą białek nośnikowych lub inne mechanizmy. To trawienie kończy się procesem wieloetapowym, podczas którego białka są denaturowane i stopniowo dzielone na ich składowe peptydy przez sekwencję enzymów.
Uniwersytet Mansoura stwierdza, że pierwszy etap chemiczny w kierunku trawienia białek zachodzi w żołądku. Żołądek jest pierwszym narządem przechowującym stałe pożywienie, na które uwalnia sok żołądkowy, mieszankę kwasu solnego i enzymów. Kwas rozpoczyna proces denaturacji, który jest rozpadem wtórnego i trzeciorzędowego fałdowania białek. Aktywuje również pepsynę, ważny enzym atakujący białka. W szczególności, pepsyna rozbija wiązanie peptydowe w aromatycznych aminokwasach. Kiedy białka opuszczają żołądek, są rozbijane na duże polipeptydy i inne związki, takie jak proteozy i peptony.
W jelicie cienkim uwalniane są soki trzustkowe i jelitowe zawierające więcej enzymów. Uniwersytet Mansoura wyjaśnia, że każdy enzym w soku trzustkowym działa na inną kategorię aminokwasów, a każdy enzym w soku jelitowym działa na polipeptydy o różnej długości.