National Geographic spekuluje, że Mt. Fuji rozwija dużą rezerwę magmy bazaltowej w oparciu o wzrost trzęsień ziemi po raz pierwszy odnotowany na początku 2000 roku. Ciepło i gaz wyprowadzane na powierzchnię przez bazową magmę powodują te wstrząsy.
Niszczycielska siła erupcji z 1707 roku mogła zmienić wewnętrzną strukturę wulkanu, co oznacza, że obecnie może zawierać inny rodzaj magmy niż w przeszłości, kiedy wulkan wybuchał regularnie co 30 lat. Japoński rząd obawia się, że obecny stan uśpienia góry może pozwolić mu gromadzić się na bardziej wybuchowej magmie.
