Linnaeus oparł swój wczesny system klasyfikacji na organach rozrodczych roślin, zgodnie z historią Carla Linnaeusa na stronie internetowej Muzeum Paleontologii Uniwersytetu Kalifornijskiego. Klasa i kolejność rośliny zadecydowały jego pręciki (organy męskie) i słupki (organy żeńskie). Rośliny bez oczywistej orientacji seksualnej zostały wrzucone do klasy Cryptogamia, znanej też jako "roślina z ukrytym małżeństwem".
Ostatecznie Linneusz opracował system, który hierarchicznie porządkował życie i rzeczy nieożywione, zgodnie z Portalem Edukacji. Jego system przeszedł z najszerszej kategorii do najbardziej szczegółowej w porządku malejącym. Poprzez badanie morfologii, pojawienia się stworzenia, Linneusz sklasyfikował ponad 11 000 organizmów. Podczas gdy współczesna nauka wykorzystuje filogenetykę (relacje ewolucyjne) jako podstawę organizacji, praca Linnaeusa jest nadal uważana za podstawę taksonomii.
Teoria ewolucji Karola Darwina zmieniła sposób, w jaki naukowcy podzielili na kategorie istoty żywe. Podczas gdy biolodzy zgadzają się z Linnaeusem na umieszczanie świń, jeżyn i ludzi w rodzaju Mammalia, robią to z różnych powodów, zgodnie z Understanding Evolution z University of California Museum of Paleontology. Podczas gdy Linnaeus dążył do grupowania gatunków według wyglądu, nowocześni taksonomowie podążają za teorią ewolucyjną, że trzy gatunki miały cztery nogi i opiekowały się młodymi, ponieważ pochodziły od wspólnego przodka.