Bieganie działa na mięśnie czworogłowe, ścięgna udowe, pośladki, zginacze biodra, mięśnie brzucha, łydki, piszczelowe mięśnie przednie i poronowe. Chociaż ćwiczenie nie buduje tych mięśni ani nie wzmacnia ich, czyni je zdolnymi większej wytrzymałości.
Bieganie jest szczególnie skuteczne w pracy z większymi mięśniami nóg, takimi jak mięśnie czworogłowe, które są dotknięte, gdy dana osoba rozciąga kolano, oraz ścięgna podkolanowe, które wyginają kolana, powodując przemieszczanie się podudzia w kierunku pośladków. Jednak bieganie działa również na mniejsze mięśnie, w tym mięśnie przednie piszczelowe, które biegną wzdłuż frontu goleni i poroneals, które biegną wzdłuż boków goleni.
