Chloroplasty są organellami innymi niż jądro i mitochondria, które zawierają własne DNA. Chloroplasty występują w roślinach i niektórych formach protistów. Ich DNA i rybosomy znajdują się w zrębie.
Chloroplasty są miejscem fotosyntezy w roślinach i zawierają zielony pigment znany jako chlorofil. Ich DNA to duże okrągłe cząsteczki, które zawierają około 120 genów, w zależności od gatunku rośliny. Znaczna część struktury chloroplastu jest podobna do mitochondriów i podobnych do mitochondriów, uważa się, że chloroplasty wyewoluowały z bakterii. Sekwencję genów kilku rodzajów chloroplastów DNA zsekwencjonowano, w tym tytoń i wątrobę.