Organelle, które zawierają enzymy trawienne, są nazywane lizosomami. Te struktury komórkowe działają przede wszystkim w celu rozpadu złożonych substancji molekularnych, takich jak węglowodany, lipidy, białka i kwasy nukleinowe.
Komórki organizmów eukariotycznych są podzielone na grupy funkcjonalne zwane organellami, które wykonują wysoce wyspecjalizowane zadania w komórce. Większość organelli jest związana błoną lub otoczona przez błonę plazmatyczną. Chociaż podobny kształt i organizacja do błony komórkowej komórki, skład membrany organelli ma inny skład białek i fosfolipidów. Niektóre organelle, takie jak aparat Golgiego i jądro, istnieją jako pojedyncze jednostki, podczas gdy inne, w tym chloroplasty, mitochondria i lizosomy, występują w dużych ilościach.
Lizosomy są mikroskopijnymi, podobnymi do worka strukturami zawieszonymi w cytozolu błony komórkowej komórki. Enzymy trawienne zawarte w tych organellach są nazywane kwaśnymi hydrolazami. Oprócz rozpadu cząsteczek jedzenia, enzymy trawią uszkodzone błony, pomagając w recyklingu zużytych części komórki. Inną ważną funkcją lizosomów jest zapobieganie inwazji komórek przez mikroorganizmy. Szkodliwe bakterie i wirusy są zwykle celowane i trawione przez lizosomy znajdujące się w białych ciałkach krwi. Ze względu na ich właściwości trawienne, hydrolazy kwasowe są izolowane od reszty komórki przez błonę, która otacza lizosomy. W przeciwnym razie enzymy strawią wszystkie składniki komórkowe.