Oddychanie komórkowe i fermentacja to dwie ścieżki, które następują po glikolizie. Oddychanie komórkowe wymaga tlenu, podczas gdy fermentacja następuje w nieobecności. Oddychanie komórkowe składa się ze szlaku chemicznego o nazwie cykl Krebsa lub cykl kwasu cytrynowego, po którym następuje system transportu elektronów.
Reakcja przejściowa zachodzi po glikolizie i zanim zacznie się oddychanie lub fermentacja. Pirogronian, produkt glikolizy, jest przetwarzany w acetylo-CoA, cząsteczkę wysokoenergetyczną. Reakcje w cyklu Krebsa przetwarzają acetylo-CoA na cząsteczki przenoszące elektrony ATP i NADH. System transportu elektronów przepuszcza je przez chemiczne membrany gradientowe, aby stworzyć dodatkowy ATP stosowany do zasilania procesów komórkowych. Fermentacja przekształca acetylo-CoA w etanol lub kwas mlekowy.
