Fizyczne cechy Azji Południowo-Wschodniej obejmują pasma górskie, równiny, półwyspy, proste i wyspy. Wietnam i Indonezja są dobrze znane ze swoich pasm górskich. Najwyższą górą w Azji Południowo-Wschodniej jest Hkakabo Razi w Myanmar, która ma ponad 19 000 stóp wysokości. Inne ważne funkcje to Tonle Sap Basin i Niziny Mekong w Kambodży. Wyspy i wulkany Archipelagu Malezji są również częścią Azji Południowo-Wschodniej.
Półwysep Malajski jest częścią Azji Południowo-Wschodniej i obejmuje kraje Tajlandii, Singapuru oraz części Malezji i Birmy. Ten półwysep dzieli centralne pasmo górskie, które obejmuje górę Tahan. Rzeki płyną na wschód i zachód od półwyspu. Rzeka Pahang jest godna uwagi, ponieważ jest najdłuższą rzeką na Półwyspie Malajskim i obejmuje w sumie 271 mil.
Wiele krajów w Azji Południowo-Wschodniej graniczy z oceanem, więc region ma kilka prostych, zatok i delt. Należą do nich Straight of Malacca, Singapore Straight i Gulf of Thailand. Azja Południowo-Wschodnia obejmuje również ponad 25 000 wysp położonych na archipelagu Malezji. Archipelag składa się z kilku mniejszych wyspiarskich łańcuchów. Te mniejsze archipelagi to Indonezja, Wyspy Filipińskie, Wyspy Maluku, Nowa Gwinea i okoliczne wyspy.