Przykładami naturalnych ekosystemów są lasy tropikalne, łąki, pustynie i rafy koralowe. Naturalny ekosystem definiuje się jako społeczność biologiczną w określonym miejscu, a także czynniki fizyczne i chemiczne, które powodują do środowiska.
Ekosystemy tropikalnych lasów tropikalnych mają bardzo gęstą roślinność i większą różnorodność gatunków zwierząt i roślin niż jakikolwiek inny typ ekosystemu.
Ekosystem użytków zielonych składa się głównie z trawy z kilkoma drzewami i krzewami. Trawiaste tereny sawanny mają dużą liczbę pasących się zwierząt i drapieżników. Trawiaste łąki stepowe są zwykle pozbawione krzewów i drzew.
Ekosystem pustynny charakteryzuje się suchym klimatem, rzadką roślinnością i bardzo niewielką liczbą zwierząt i owadów.
Ekosystemy raf koralowych znajdują się pod powierzchnią oceanów i są domem dla wielu gatunków koralowców i ryb.
