Istnieje wiele różnic między komórkami roślin i zwierząt, ale jedną z najbardziej oczywistych różnic jest to, że komórki roślinne mają ścianę komórkową. Komórki zwierzęce nie mają ściany komórkowej. Komórki zwierzęce mają nieregularny kształt, a komórki roślinne mają stały, prostokątny kształt.
Ściany komórkowe nadają komórkom roślinnym swój kształt i pomagają regulować komunikację międzykomórkową. Ściana komórkowa pozwala również wodzie, tlenowi i dwutlenkowi węgla na przedostawanie się i opuszczanie komórek roślinnych. Rośliny wykorzystują dwutlenek węgla i wodę do produkcji cukru podczas procesu fotosyntezy.
Inną ważną różnicą między komórkami roślin i zwierząt jest obecność chloroplastów w komórkach roślinnych. Chloroplasty zawierają pigment, który pochłania energię wytwarzaną przez słońce. Rośliny wykorzystują tę energię do napędzania fotosyntezy. Fotosynteza nie występuje u zwierząt, więc nie ma potrzeby stosowania chloroplastów w komórkach zwierzęcych. Komórki roślinne również posiadają plastyd, ale komórki zwierzęce nie.
Komórki zwierzęce i komórki roślinne mają inne wspólne części lub organelle, takie jak gładka i szorstka retikulum endoplazmatyczne, rybosomy i mitochondria. Jądro działa jako centrum kontrolne komórki i jest obecne zarówno w komórkach zwierzęcych, jak i komórkach roślinnych. Komórki zwierząt mają centriole, ale komórki roślinne mają tylko te cylindryczne struktury w niższych formach roślin. Lizosomy są powszechne w komórkach zwierzęcych, ale zwykle nie występują w komórkach roślinnych. Łososomy znajdujące się w komórkach zwierzęcych trawią stare części komórek i rozkładają duże cząsteczki pokarmu.