Do częstych działań niepożądanych związanych z doustnymi terapiami na serce należą biegunka, wymioty i brak koordynacji mięśni. Skutki uboczne leczenia miejscowego heartworm obejmują wypadanie włosów w miejscu podania, biegunkę, wymioty, drżenie, dyszenie i ślinotok. Efekty uboczne do wstrzykiwania heartworm to napad padaczkowy, wstrząs, obrzęk, podrażnienie skóry lub swędzenie, biegunka i wymioty. Rzadko u psów występują działania niepożądane w postaci leczenia heartworm.
Oprócz występowania działań niepożądanych związanych z kuracją heartworm, niektóre psy mogą również odczuwać reakcje uczuleniowe na składniki leku na heartworm. Pies doświadczający reakcji alergicznej może wykazywać objawy, takie jak drgawki, wstrząsy, pokrzywka, swędzenie i obrzęk, szczególnie w okolicy twarzy. Psy, które mają ciężką infestację heartworm mogą być bardziej podatne na niepożądane reakcje na leczenie.
Niektóre rasy psów są szczególnie wrażliwe na składniki aktywne w większości kuraków heartworm, ivermectin i milbemycin. Wiele collie, whippety, owczarki australijskie i owczarki mają genetyczną mutację, która sprawia, że nie są w stanie oczyścić z mózgów leków zawierających heartworm. Ta nieprawidłowość może zwiększyć szanse tych psów cierpiących na napady padaczki lub nawet umrzeć w wyniku podjęcia leczenia heartworm.
Heartworm to poważna choroba uznawana za endemiczną w wielu obszarach. Większość lekarzy weterynarii uważa, że korzyści z leczenia zapobiegawczego dżdżownic przewyższają ryzyko wystąpienia działań niepożądanych.