Głównym zastosowaniem kwasu fosforowego jest produkcja nawozów sztucznych, chociaż jest on również stosowany do wytwarzania syntetycznych detergentów. Inne zastosowania kwasu fosforowego obejmują obróbkę wody i metalu, a także jest on czasem stosowany jako dodatek do niektórych artykułów spożywczych i napojów.
Kwas fosforowy jest stosowany jako dodatek i środek aromatyzujący zarówno w żywieniu ludzi jak i zwierząt. Jest powszechnie stosowany w napojach gazowanych, aby zapewnić ostry lub kwaśny smak. Prawdę mówiąc, prawie cały kwaśny aromat sody pochodzi z kwasu fosforowego, ponieważ kwas węglowy zawarty w pęcherzykach ma niewielki wpływ na ogólne pH. Kwas fosforowy pomaga również zapobiegać tworzeniu się bakterii i grzybów w tych słodkich napojach.
Fosfor jest jednym z najważniejszych składników odżywczych roślin. W celu dodania dodatkowego fosforu do gleby, kwas fosforowy przekształca się w fosforany, które następnie miesza się z innymi składnikami w celu utworzenia nawozu. Ponad 80 procent kwasu fosforowego produkowanego na świecie wykorzystuje się do produkcji nawozów. Począwszy od 2014 r. Azja jest największym na świecie producentem kwasu fosforowego, produkując około 14 milionów ton rocznie. Ameryka Północna jest druga w produkcji, z roczną produkcją około 10 milionów ton.