Południowa Korea jest domem dla wielu różnych rodzimych ssaków i ptaków. Niektóre z nich, takie jak zagrożony bahikal, żyją głównie w lokalnym biomie, podczas gdy inne, takie jak wieloryby, odwiedzaj sezonowo wody w pobliżu Korei Południowej.
Wieloryby należą do najbardziej spektakularnych turystów w Korei Południowej. Gatunki wielorybów, które można znaleźć w promieniu kilku mil od wybrzeża to garb, sperma i szare wieloryby. W głębi kraju, w Korei Południowej występują ryby rzeczne i jeziorne, z których niektóre nie występują nigdzie indziej na Ziemi. Należą do nich: Somjiny bitterling, koreański chudy byczek, kilka gatunków loacha i czarny shiner.
Korea Południowa ma cztery rodzime gatunki salamandry, w szczególności koreańską salamandrę szczelinową. Ten gatunek jest niezwykły jako jedyny bezmyślny gatunek salamandry znany jako endemiczny dla Azji. Dorośli oddychają bezpośrednio przez skórę, a nie płucami, tak jak robią to koreańskie szpony salamandry.
Mysz z pasiastą polną jest powszechna w Azji Wschodniej, ale Korea Południowa ma swój własny wariant, mysz polną w paski Jeju, którą niektórzy naturaliści zasugerowali, należy sklasyfikować jako własny gatunek. W Korei Południowej jest wiele rodzimych bezkręgowców, w tym katydid (Sphagniana monticola), ćma (Pyrausta nigrimaculata) i longhorned chrząszcz (Demonax seoulensis).
