Cladistics ilustruje stale rozwijające się relacje ewolucyjne między formami życia, podczas gdy system Linneusza klasyfikuje organizmy zgodnie ze stałymi cechami fizycznymi. Cladistics organizuje całe życie w ramach teorii ewolucji, podczas gdy system Linneusza sięga z powrotem do arystotelesowskiej koncepcji nazw naukowych.
Cladistics to metoda opracowana w celu połączenia modelu ewolucyjnego z praktyczną potrzebą klasyfikacji organizmów. Cladistics pokazuje gałęzie ewolucji i pozwala użytkownikom zobaczyć, jak blisko spokrewniony jest jeden gatunek z innym gatunkiem w dowolnym momencie ich historii ewolucyjnej. Cladistics organizuje życie zgodnie z historią rozwoju, a nie podobieństwo jednej formy życia z inną w tym samym czasie. Cladistics nie jest przeznaczony do użytku poza pracą obejmującą teorię ewolucji.
Carl Linneusz rozwinął swój system, aby nadać każdej odrębnej formie uniwersalne imię i miejsce w strukturze całego życia według fizycznych podobieństw. Ta struktura oznacza gatunek, rodzaj, rodzinę, porządek, klasę i królestwo dla każdego organizmu. Linnaeus opierał się na poprzednim modelu klasyfikacji oferowanym przez Arystotelesa, choć Linnaeus zmienił i powiększył model Arystotelesa. System Linneusza grupuje gatunki o fizycznych podobieństwach, niezależnie od różnych sposobów ich rozwoju u każdego gatunku.