Pierwszym odkrywcą bakterii jest holenderski handlowiec i naukowiec Antony van Leeuwenhoek. Znacznie ulepszył mikroskop, odkrył pierwotniaki (które nazwał zwierzęciarzami) i stworzył podstawy mikrobiologii.
Antony van Leeuwenhoek, urodzony w 1632 roku, przeciwstawił się odkryciom, ponieważ był stosunkowo niewytrenowany w naukach ścisłych. Pomimo braku formalnego wykształcenia był pierwszą osobą, która zaobserwowała i zarejestrowała organizmy jednokomórkowe, bakterie, włókna mięśniowe i plemniki. Dzięki swojej pracy inni naukowcy zbudowali na jego fundamencie, wnosząc znaczny wkład w dziedzinę współczesnej medycyny i biologii.