Drobnoustroje są użyteczne dla ludzi na niezliczoną ilość sposobów. Członkowie tej grupy organizmów zajmują się ludzkimi zajęciami, od produkcji i testowania medycyny po uprawę, przygotowanie i trawienie żywności. Naukowe badanie mikrobów wzbogaca wiedzę ludzkości na temat genetyki, chorób i innych aspektów życia na Ziemi.
Drobnoustroje pomagają ludziom bezpośrednio na wiele sposobów. Niektóre drobnoustroje wytwarzają związki lecznicze lub bioaktywne, takie jak antybiotyk penicylina, która jest naturalnie pochodną rodzaju pleśni. Inne drobnoustroje są wykorzystywane do fermentacji warzyw, ziaren i produktów mlecznych w celu przygotowania ogórków, chleba, alkoholu, jogurtu i sera. Naukowcy używają drobnoustrojów jako organizmów modelowych i żywych narzędzi w laboratorium, a wykorzystywanie drobnoustrojów do badania genetyki człowieka, biochemii i chorób zrewolucjonizowało ludzkie zrozumienie świata biologicznego. Drobnoustroje są również wykorzystywane do wykonywania podstawowych czynności w procesach przemysłowych, takich jak rekultywacja ścieków.
Naturalna aktywność drobnoustrojów również przynosi pośrednie korzyści ludzkości. Rozpad materii organicznej i recykling składników pokarmowych w ekosystemach rolniczych i naturalnych osiągają mikroorganizmy. Mikroby są również odpowiedzialne za wiązanie azotu atmosferycznego, co zwiększa żyzność gleby w tych systemach. Występujące naturalnie wspólnoty drobnoustrojów pomagają również kontrolować rozprzestrzenianie się patogenów roślinnych i zwierzęcych oraz ograniczać populację szkodników owadzich. Ostatecznie mikroby są odpowiedzialne za regulację większości globalnych systemów, dzięki którym Ziemia staje się gościnna dla ludzi.