Encyklopedia Britannica wyjaśnia, że pepsyna jest najbardziej aktywna w żołądku. Pepsyna nie jest już skuteczna w jelicie, gdzie kwasy żołądkowe są neutralizowane. Siła trawienna Pepsyna jest najbardziej znacząca na poziomie kwasowości zwykłego soku żołądkowego.
Pepsyna jest enzymem występującym w soku żołądkowym. Gleje białka znajdujące się w produktach spożywczych, takich jak produkty mleczne, jaja, mięso i nasiona. Pepsyna wytwarzana jest w żołądku, gdzie kwas solny łączy się z nieaktywnym białkiem, znanym jako pepsinogen. Pepsyna jest również aktywna w niewielkich ilościach we krwi, gdzie rozkłada większe lub częściowo niestrawione fragmenty białka, które mogło wchłonąć jelito cienkie.