Kwaśne deszcze powodują szereg efektów ekologicznych, w tym zakwaszenie jezior, strumieni, mokradeł i innych krajobrazów wodnych. Kwaśny deszcz przyspiesza także rozkład budynków, niszczy drzewa na dużych wysokościach i uszkadza las gleby.
Oprócz kwasu siarkowego i azotowego z samego wytrącania, kwaśne deszcze uwalniają aluminium również do systemów wodnych z interakcji z glebami w zlewni. Kiedy kwaśny deszcz przepływa przez gleby w zlewni, uwalnia aluminium. Gdy przepływa przez pobliskie linie brzegowe i glebę, aluminium jest absorbowane w glebie. Napływ kwaśnych deszczy i aluminium powoduje, że wody są toksyczne dla większości organizmów wodnych, w tym ryb, małży i raków.
Kwaśne deszcze powodują również poważne uszkodzenia drzew i lasów na wyższych wysokościach, ponieważ usuwają z gleby żywe składniki odżywcze i uwalniają aluminium, co utrudnia drzewom wchłanianie wody. Kwaśny deszcz zmniejsza zdolność drzew i roślin do wytrzymywania chorób, owadów i niskich temperatur, a także może wpływać na rozmnażanie się na drzewach.
Kwaśny deszcz odnosi się do opadów o wysokim poziomie kwasów siarkowych i azotowych. Występuje w procesach naturalnych, takich jak erupcje wulkanów i gnijąca roślinność, ale częściej jest wynikiem spalania paliw kopalnych. Jedynym sposobem na ograniczenie skutków kwaśnych deszczów jest ograniczenie uwalniania paliw kopalnych i innych zanieczyszczeń, które je powodują.
