Hodowcy mogą wywoływać mutacje przy użyciu substancji chemicznych zmieniających DNA na nasionach roślin, stosując kultury tkankowe lub wystawiając rośliny na promieniowanie, takie jak promienie X, promienie gamma i neutrony termiczne. Te metody zmiany DNA powodują zmiany genetyczne w rośliny rosną.
Hodowla mutacji jest stosowana do różnych roślin i źródeł żywności, w tym pszenicy, orzeszków ziemnych, grejpfruta i pomidorów. Hodowcy wybierają rośliny o pożądanych cechach jako przyszłe stada hodowlane. Hodowcy, którzy wywołują mutacje, nie mają zagwarantowanych roślin posiadających pożądane cechy, ponieważ wszystkie mutacje są przypadkowe. W niektórych przypadkach hodowcy krzyżują dwie zmutowane rośliny o pożądanych cechach z nową rasą. Ta technika została wykorzystana przez badacza Zachary'ego Lippmana do produkcji pomidorów hybrydowych, które dały dwa razy więcej owoców niż standardowe rasy.
Hodowla mutacji została odkryta w latach 20. XX w. i stała się popularna po II wojnie światowej, ponieważ technologia jądrowa zaowocowała postępem techniki hodowlanej. Od 2015 r. Obszerna baza danych zmutowanych odmian roślin jest dostępna na stronie iaea.org. Baza danych jest wspierana przez Organizację ds. Wyżywienia i Rolnictwa Narodów Zjednoczonych oraz Międzynarodową Agencję Energii Atomowej. Baza danych zawiera listę zmutowanych roślin według nazwy odmiany, nazwy łacińskiej, nazwy zwyczajowej, kraju mutacji i roku rejestracji. Baza danych zawiera także zaawansowaną wyszukiwarkę roślin mutantów, która pozwala na wybór roślin według typu hodowlanego, mutacji i mutacji.