Kwaśny deszcz ma wiele skutków ubocznych dla środowiska, ale jego wpływ w dużej mierze jest widoczny na źródłach wody i środowisku wodnym, takich jak jeziora, tereny podmokłe i strumienie, wyjaśnia National Geographic. Kwaśny deszcz zmniejsza alkaliczność, zdolność wody do neutralizowania kwasu, a przez to zwiększa kwasowość wody, prowadząc do słabszego ekosystemu. Kwaśna woda jest również toksyczna dla ryb, małży, raków i innych zwierząt wodnych.
Kiedy kwaśne deszcze padają na lasy, zmywa i rozpuszcza składniki odżywcze, które pomagają drzewom i roślinom rosnąć, takie jak magnez i wapń. Uwalnia aluminium, które zmniejsza zdolność drzew do wchłaniania wody. Podczas gdy drzewa nie są w stanie wchłonąć naturalnie występującego aluminium, kwaśny deszcz może przekształcić go w azotan aluminium lub siarczan glinu, który może zaszkodzić drzewom. Osłabia naturalne mechanizmy obronne drzew i czyni je bardziej podatnymi na uszkodzenia spowodowane przez zimną pogodę, owady, choroby i inne stresory ekologiczne. Kwaśny deszcz również niweluje ochronną powłokę liści, czyniąc je bardziej podatnymi na uszkodzenia i zapobiegając ich odpowiednio fotosyntezie.
Oprócz skutków dla środowiska, kwaśne deszcze mogą również powodować szybsze erozję budynków i posągów, zwłaszcza tych wykonanych z wapienia lub piaskowca, ponieważ te skały łatwo ulegają zanieczyszczeniu powietrza, a także kwaśnym deszczom.