Białko markerowe istnieje w błonie komórkowej i służy jako identyfikator komórki. Białko analizuje każdego najeźdźcę, wiążąc się z nim i wywołując wizualną odpowiedź, aby podjąć decyzję.
Układ odpornościowy organizmu używa białek markerowych, aby odróżnić przyjazne komórki od obcych najeźdźców. Białka markerowe są unikatowymi identyfikatorami, tak jak ludzkie odciski palców, nie ma dwóch takich samych.
Białka te odgrywają ważną rolę w przeszczepach narządów ludzkich. Jeśli białka markerowe na przeszczepionym narządzie są różne od tych z oryginalnego organu, ciało odrzuci je jako obcy najeźdźca.