Cząsteczki amfipatyczne to cząsteczki posiadające w swojej strukturze zarówno polarne, jak i niepolarne części. Związki chemiczne, które cechują te cząsteczki, są niezbędne dla wielu procesów biologicznych i przemysłowych.
Mydła, detergenty i lipoproteiny to przykłady cząsteczek amfipatycznych. Niepolarna część amfipatycznej cząsteczki jest hydrofobowa, co oznacza, że jest odpychana od cząsteczek wody. Ta niepolarna część jest również lipofilowa, co oznacza, że jest przyciągana do innych organicznych cząsteczek. Część niepolarna to zazwyczaj długołańcuchowy węglowodór.
Część polarna cząsteczki może składać się z różnych grup rodnikowych obejmujących karboksylany, siarczany, fosforany i sulfoniany. Ta część polarna zachowuje się w sposób prawie przeciwny do części niepolarnej, ponieważ przyciąga ją woda i jest odpychana przez cząsteczki polarne.
Związki amfipatyczne często mają kilka lipofilowych i kilku hydrofilowych części przyłączonych do centralnego szkieletu węglowego. Fosfolipidy są klasą amfipatycznej cząsteczki niezbędnej do życia. Te cząsteczki są głównym składnikiem błon biologicznych. Specyficzne zachowanie amfipatyczne cząsteczek fosfolipidów zależy od ich połączenia. Inne ważne biosyntetyzowane cząsteczki amfipatyczne to cholesterol i glikolipidy.
Sztuczne cząsteczki amfipatyczne można dostosować, aby przyciągać i złuszczać niepożądane gatunki organiczne, dzięki czemu mogą funkcjonować jako surfaktanty.