W formule molekularnej indeks dolny jest zapisywany bezpośrednio po literze oznaczającej element i odnosi się do ilości atomów tego pierwiastka. Wzór cząsteczkowy, czyli wzór empiryczny, jest zapisywany jako seria liter i cyfr reprezentujących związek lub cząsteczkę. Każda litera we wzorze symbolizuje jeden element z układu okresowego pierwiastków.
Na przykład tlenek węgla jest zapisywany jako CO, podczas gdy dwutlenek węgla jest zapisywany jako CO2. Liczba druga to indeks dolny, oznaczający dwa atomy tlenu w związku. Jeśli symbol elementu nie ma indeksu dolnego, takiego jak CO, wówczas zakłada się, że istnieje tylko jeden atom każdego elementu.