Czynniki biotyczne to żywe organizmy wpływające na dany ekosystem i ich relacje. Ryby, żaby, rośliny wodne, bakterie i owady są czynnikami biotycznymi w siedlisku rzecznym.
Pośrednie pomiary czynników biotycznych stanowią cenną informację o środowisku i jego mieszkańcach. Wysokie stężenie chlorofilu a w estuarium jest wskaźnikiem rozkwitu glonów; niebezpieczny wzrost liczby glonów, które mogą doprowadzić do wymarcia mieszkańców estuariów. Spadek bioróżnorodności oznacza zmniejszenie stanu zdrowia ekosystemu.
Czynniki abiotyczne to nieżyjące oddziaływania na ekosystem i obejmują pogodę, formy terenu, zasolenie wody i wydarzenia geologiczne. Pomiary gęstości gleby, dostępności wody i godzin nasłonecznienia wskazują na prawdopodobieństwo przeżycia roślin i przetrwania zwierząt zależnych od tej rośliny jako źródła pożywienia. Wzorce pogodowe suszarni zmieniają skład siedliska w gatunki przyjazne suszom.
Badania czynników biotycznych i abiotycznych mają wpływ komercyjny. Termity podziemne Formosa powodują w Stanach Zjednoczonych straty sięgające 2 miliardów dolarów rocznie. Określenie wartości określonego kształtu terenu dla termitów umożliwia skoncentrowane działania prewencyjne w jego lokalizacji. Zanieczyszczenie Methylmercury z elektrowni węglowych gromadzi się w tkankach rybnych i nie tylko powoduje szkody dla rybołówstwa sportowego, ale wymaga nowych protokołów ostrzegających przed niebezpiecznym spożywaniem żywności.
