PKa aminokwasu zależy od jego rodzaju, grupy i łańcuchów bocznych. Na przykład, gdy lizyna jest częścią grupy kwasu karboksylowego, jej pKa wynosi 2,18, w porównaniu z pKa 8,95, gdy jest częścią grupy aminowej i 10,53 z łańcuchami bocznymi.
W grupie kwasu karboksylowego większość aminokwasów ma wartości pKa nieco powyżej 2, przy czym tylko histydyna spada poniżej z pKa 1,77. Kwas o wartości pKa poniżej 2 uważany jest za silny kwas, podczas gdy powyższe uważa się za słabe kwasy. Aminokwasy w grupie aminowej mają wartości pKa w zakresie od wysokich 8s do niskich 10s.
