Zgodnie z edukacją przyrodniczą, enzymy restrykcyjne stosuje się do cięcia DNA na mniejsze kawałki, które można następnie rozdzielić poprzez elektroforezę żelową. Typowe enzymy restrykcyjne wycinają DNA w czterech lub sześciu miejscach rozpoznawania par zasad, otrzymując bardzo małe fragmenty DNA.
Według strony internetowej Colorado State Biotechnology, enzymy restrykcyjne pochodzą z enzymów bakteryjnych, które są formą szczątkowego układu odpornościowego dla bakterii. Te enzymy wyewoluowały, aby ciąć i niszczyć dowolny obcy DNA w bakteriach, dlatego tną DNA na małe kawałki. Enzymy restrykcyjne i elektroforeza żelowa są również wykorzystywane do technologii rekombinacji DNA, która pozwala na zamiany genów inżynierskich w DNA i poza nim dla celów klonowania.
